Đại học Kobe là một trong những trường đại học Nhật Bản có uy tín hàng đầu trong nghiên cứu. Theo bảng xếp hạng Shanghai Ranking năm 2018 thì Đại học Kobe đứng thứ 13 ở Nhật Bản[4]

Bảng xếp hạng QS Japan University Ranking năm 2019 xếp Đại học Kobe thứ 12 Nhật Bản[5] với mức đánh giá cao nhất về năng lực nghiên cứu và công bố sản phẩm khoa học.[6]

Tổ chức Times Higher Education xếp Đại học Kobe thứ 16 Nhật Bản vào năm 2019[7]

Riêng Trường Quản trị Kinh doanh (Graduate School of Business Administration) của Đại học Kobe được Eduniversal xếp hạng 4 lá cọ (4 palmes) tức ở mức xuất sắc (exellence) dành cho trường kinh doanh có sức ảnh hưởng quốc tế đặc biệt.[8]